Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 场的分割和分析

好酷屋教程网小编为您收集和整理了Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 场的分割和分析的相关教程：简介：MaterialsVisualizer中的体积可视化工具提供了一种强大的方式来可视化由介观、吸附和量子方法以及原子体积和表面工具生成的场数据。等值面用于通过链接特定等值的场点来帮助显示场数据

简介：Materials Visualizer 中的体积可视化工具提供了一种强大的方式来可视化由介观、吸附和量子方法以及原子体积和表面工具生成的场数据。等值面用于通过链接特定等值的场点来帮助显示场数据。如果生成包含孤立线段的等值面，不选择等值面的所有段，则不可能选择这些单独的段。

解决此问题的一种方法是允许将基础字段分成许多子字段。每个子字段，或分割，代表原始字段的一个独特部分。可以选择一个分割的场，并且可以获得场体积和几何中心等各种有用的属性，从而可以改进对场数据的分析。

Field segregation可用于 Materials Visualizer 中的任何场，提供来自无定形单元的自由体积分布、来自介观计算的胶束尺寸分布的访问，并允许您对沸石中的受限孔执行吸附计算。

在本教程中，您将计算沸石的 Connolly 曲面。使用底层 Atom Volumes 字段，您将在特定等值处分割该字段，然后分析这些分割。

目的：演示如何对原子体积场进行场分割。

本教程重要节点：

计算康纳利表面-分割原子体积场-分析segregates

1.计算康纳利表面

第一步是生成要分割的字段数据。 您将生成一个基于底层 Atom Volumes Field 的 Connolly 曲面。 您可以为任何结构生成 Atom Volumes Field，但在本例中，您将使用沸石。

单击 Standard 工具栏上的 Import 按钮打开 Import Document 对话框，导航到并打开 Examples\Documents\3D Model\TON.msi。

现在您可以使用 Atom Volumes & Surfaces 工具计算 Connolly 曲面。

选择菜单栏中的Tools | Atom Volumes & Surfaces。

这将打开 Atoms Volumes & Surfaces 对话框。 默认任务是计算 Connolly 曲面。 您还可以通过更改任务来计算溶剂曲面，但您将在本教程中使用 Connolly 曲面。

单击Create按钮。

等值面在 atomistic 文档中生成，对话框更改为 Analysis 选项卡。

对话框上的树视图显示了 Atom Volumes Field 的存在，即使它目前没有显示。该复选框显示 Connolly 曲面是可见的。您可以从“显示样式”对话框显示该字段

在 3D 查看器中单击鼠标右键，然后从快捷菜单中选择Display Style以打开“显示样式”对话框。选择Field选项卡并选中Show box复选框，选择Dots按钮。

该字段以红色显示低值，蓝色显示高值。一旦 Show box 复选框被标记，可见性可以从 Atoms Volumes & Surfaces 对话框中切换。您现在可以使该字段不可见。

在 Atoms Volumes & Surfaces 对话框中，取消选中 Atom Volumes Field 复选框。

您可以更改 Connolly 探针的半径以查看探针尺寸对结构中自由体积的影响。

单击Connolly radius降速控件。

当您减小 Connolly 探针的大小时，结构中的自由体积会随着等值面的大小增加并形成连接结构而增加。对于本教程的其余部分，您需要有一些独立的分割区，因此您应该增加探测半径。

将Connolly radius设置为 0.90。关闭 Atom Volumes & Surfaces 对话框。

2.分割原子体积场

如果您尝试选择等值面的其中一个部分，您将看到整个等值面被选中。如果您想找到等值面的孤立部分的体积，这是一个限制。

单击等值面的部分之一。

分割将基础字段拆分为单独的字段分割。可以选择其中的每一个来检查诸如分割的体积和中心之类的属性。用于创建、管理和操作分割的工具位于 Volume Visualization 工具栏上。

单击 3D 查看器中的任意位置以取消选择所有内容。从菜单栏中选择View | Toolbars | Volume Visualization。单击Create Segregates按钮创建分割。

分割的字段在结构中显示为较小的字段框，字段以不同的颜色显示。您可以选择单独的字段分割来查看体积。

打开Properties Explorer，单击其中一个小字段分割。

Properties Explorer Filter 更改为 Segregate。在这里，您可以看到不同的属性，例如表示字段体积的 Field Volume 和显示分割中心的 Segregate XYZ。

在模型文档中单击以取消选择分割。

您可以使用体积可视化工具栏上的体积选择工具来选择分割。

单击体积可视化工具栏上的Volumetric Selection按钮。

这将打开体积选择对话框，其中显示体积数据的树形视图。您可以隐藏 Connolly 曲面。

取消选中 Connolly Surface 复选框。

分割器由分割器@0行指示的分割器分支表示。@0显示字段以0的等值进行分割。您可以通过单击展开分支来查看分割器。

单击以展开Segregator@0分支。

结构中有几个分割项。您可以增加体积选择对话框的大小以查看所有分割项。

将光标移动到对话框的右下角。当光标变为双头箭头时，单击并向右和向下拖动。

你应该看到有14个分割。

您可以使用“属性资源管理器”或“显示样式”对话框来控制分隔哪些字段区域。

在 3D 查看器中单击鼠标右键，然后从下拉列表中选择Display Style以打开“显示样式”对话框，然后更改为Segregate选项卡。

可以使用“显示样式”和“着色”部分来控制分隔的显示方式。“约束”部分允许您控制显示哪种类型的分割。等值控制字段中分割的阈值，类似于等值面的等值属性。

增大和减小Isovalue。将值设置回 0.0。

改变等值动态地重新计算分割。

提示：如果您有一个大的、高度分割的字段，更改等值时，字段显示更新可能非常耗时。在这种情况下，最好显式设置值，而不是使用旋转控件。

您还可以指定是否希望分割项是高于或低于等值的字段值，或者您可以选择两者。

将Values更改为Low。

选择低与默认高设置相反的字段点。在此示例中，低值是有原子的字段值。将值更改为全部包括单独分割中的较高值和较低值。

将Values更改回High。

最后一个约束是连接性。它控制分割是可访问的还是分割的。分割在单元中是自包含的，而可访问的分割是无限连接的。

将Connectivities更改为Isolated。

仅显示不是无限连接的十二个分割项。

将Connectivities更改为Accessible。

仅显示无限连接的两个分割项。

提示：仅使用可访问的、连接的分割器将允许您将吸附计算的搜索空间限制为沸石中可访问的孔隙。

将Connectivities改回All。

注意：上述属性也可通过属性资源管理器和Materials Script API获得。如果您希望对多个结构执行相同的计算，使用Materials Script可能更有效。

在初始状态下，字段分隔符仅显示为字段。您可以使用标准等值面工具向它们添加等值面。

在Volumetric Selection对话框中，按住SHIFT键并选择所有分割区。单击Create Isosurfaces按钮。

等值面是在所有的分割区上创建的。他们使用用于分割的等值，并且颜色与他们的分割区相同。

3.分析segregates

您可以使用创建分割工具分析属性，例如分割的大小和分离分布。

单击Create Segregates箭头，然后选择Analyze Segregated Field。

这将打开“分割分析”对话框。默认选项是分析分割大小。

单击Analyze按钮。

将生成一个图表，显示分割大小的分布。您应该看到一个接近零的大峰，表示较小的分割分割，以及两个高于140的小峰，对应于两个可访问的分割。

提示：通过使用MaterialsScript遍历集合中的所有分割，可以自动获得每个分割的实际体积。

将焦点更改回TON.xsd.在Segregate Analysis对话框中，选择Segregate major axis，然后单击Analyze按钮。

该分析将椭球拟合到分割物，然后绘制椭球的长轴。

将焦点更改回TON.xsd.在Segregate Analysis对话框中，选择Segregate radius (best-fit sphere)，然后单击Analyze按钮。

此分析将最佳拟合球体拟合到分割，然后绘制球体的半径。

将焦点更改回TON.xsd.在Segregate Analysis对话框中，选择Segregate separation，然后单击Analyze按钮。

此分析绘制了分割区之间距离的分布。

提示：您可以先选择可见分割的子集，然后再对其进行分析，从而对这些子集执行分析。

从菜单栏中选择File | Save Project，或单击项目工具栏上的保存项目按钮保存项目。

本入门教程到此结束。

以上就是好酷屋教程网小编为您收集和整理的Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 场的分割和分析相关内容，如果对您有帮助，请帮忙分享这篇文章^_^

本文来源： https://www.haoku5.com/IT/639e8a657795d872a70a5583.html

相关推荐