Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 绘制简单分子

好酷屋教程网小编为您收集和整理了Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 绘制简单分子的相关教程：简介：在本教程中，您将学习如何在MaterialsStudio中绘制结构草图。使用MaterialsStudio中不同可视化技术，您可以轻松粘贴到其他基于Windows的软件程序或保

简介：在本教程中，您将学习如何在 Materials Studio 中绘制结构草图。 使用 Materials Studio 中不同可视化技术，您可以轻松粘贴到其他基于 Windows 的软件程序或保存为高质量图形。 您将按照提供的详细说明构建各种简单的有机化合物。 在本教程的最后，您可以自行构建一些额外的结构。

在许多情况下，修改结构的方法不止一种。 本教程向您介绍了不同的方法，以便您可以确定在给定情况下哪种方法最好。

目的：介绍基本的绘制模型工具，包括绘制链和环、编辑键类型、编辑元素类型以及测量不同的几何属性。

本教程重要节点：

入门-绘制苯酚-绘制双环戊二烯-绘制吡啶-绘制甲基丙烯酸甲酯-添加灯光效果

1. 入门

首先启动 Materials Studio 并创建一个名为 Sketching 的新项目。

打开 New Project 对话框，输入 Sketching 作为名称，然后单击 OK 按钮。

使用 Project Explorer 中列出的 Sketching 创建新项目。

2.绘制苯酚

在Sketch工具栏上单击Sketch Ring按钮，选择6 member，并在3D Atomistic.xsd文件中单击左键以绘制一个6元环。

注意：当在绘制的同时按下Alt键，会绘制带虚线的六元环，表示在这里有部分双键的性质，即为芳香键。

完成苯环之后，需要在其上加入一个氧原子，由于苯环中六个碳原子完全相同，因此可以在任何一个碳原子上加入氧原子。

在Sketch工具栏上单击Sketch Atom按钮，在任意碳原子上单击并拖拽生成氧原子。

在Sketch工具栏上单击Auto Hydrogen按钮自动为分子加入合适的氢原子，同时按下Clean按钮以获得更具有化学合理性的分子结构。

绘制完成后，可以用不同的观测工具对分子进行平移、旋转和缩放操作。

3.绘制双环戊二烯

双环戊二烯经常被用到杀虫剂和除草剂的合成工艺中。

首先在新文档中加入一个六元环（操作同上），然后再添加五元环。

在Sketch工具栏上单击Sketch Ring按钮，选择5 member，然后将鼠标移动到六元环的一个键上，当该键变为蓝色的时候按下鼠标左键，从而在该六元环上加入一个五元环结构。

选择Sketch Atom按钮，保证绘制原子为碳原子。在下图的1、2号原子之间连续单击以生成桥碳原子。

选择3、4号键，并在Bond Type按钮中将其设置为双键。
最后我们将为其加入合适的氢原子并对整个结构进行整理。得到的最终结构如下所示：

4.绘制吡啶

首先绘制一个芳香结构的六元环。除了通过选择工具选择并在相应菜单上改变分子的某些性质以外，还可以通过View菜单Explorer下的Properties Explorer管理器。

打开Properties Explorer管理器，并在工作区用3D viewer中的3D Viewer Selection Mode选中某一个碳原子，在管理器中可以修改该原子相应的性质，例如将该原子的元素符号从C改变为N，那么这个原子将由碳原子变为氮原子，同时其分子量和相关参数也同时发生变化。

此方法还可以用于改变分子、键等不同对象的性质。

完成后，我们将为这个分子加入一个氯原子取代基，

使用工具栏上的Sketch Atom按钮，可以很轻松的加入一个氯原子。

在自动加氢并进行整理之前，我们可以打开一个HTML文件记录相关的C-Cl之间的键长，以观察在整理前后键的变化情况。

在进行记录以后，我们将为该分子自动加氢并进行整理。最终得到的分子结构如下图所示。

5.绘制甲基丙烯酸甲酯

其分子结构如下：

我们不需要构造整个分子结构，一个很好的例子就是将原子加入到下列结构中，并生成相应的化合物。首先，我们必须构造如下分子：

采用sketch工具构造中间体分子，

在绘制双键的时候，可以将鼠标指到键的中心，在键变为蓝色的时候单击鼠标左键可以改变键级，重复此过程可以依次生成双键、三键，最后返回为单键。

完成中间结构后，我们需要在两个碳原子之间加入一个氧原子并且删除连接两个碳原子的键。操作过程与以上操作相类似。

完成后为结构自动加氢并进行Clean，最后得到的结构如下图所示：

6.添加灯光效果

控制照明效果的能力经常被忽视，但可以用来制作一些令人印象深刻的图像。 在本节中，您将更改第一束光的位置并添加第二束光以增强图像。 可以从View菜单或通过右键单击 3D Atomistic 文档时显示的快捷菜单访问Lighting对话框。

首先，您将更改结构的显示样式，因为线条样式不显示灯光效果。

将 2-chloropyridine.xsd 设为活动文档。 在 3D 查看器中单击鼠标右键，然后从快捷菜单中选择Display Style以打开“显示样式”对话框。 在 Atom 选项卡上，选择显示样式部分中的 CPK 选项。

原子的显示样式变为大 CPK (Corey-Pauling-Koltun) 球体，其半径取决于它们所代表的元素的范德华半径。

此对话框控制最多三个灯光的存在、它们的颜色和位置。您将移动 Light 1，使其位于球的右上角。

单击球并将鼠标向上和向右移动。

分子上的光随着光的移动而变化。当你把灯放在正确的位置时，它会看起来像这样：

现在您可以在显示屏中添加第二束光。

选中 Enable Light 2 复选框以添加第二束光。

预览框中会显示第二束光，并且第一束光的位置是固定的。第二束光是浅灰色的，但这可以改成更合适的颜色。

单击与 Enable Light 2 关联的灰色指示器。

这将显示颜色选择器。对于本教程，您将选择浅蓝色。

单击第二行中的浅蓝色框。

灯光变为浅蓝色，并更新 3D 查看器。现在您可以将灯光移动到您需要的位置。

单击并将灯光移动到球的底部，然后关闭“灯光”对话框。

预览球现在应该如下所示：

现在您可以更改显示样式和图像质量，直到获得满意的图像。

您应该保存您在项目中生成的所有结构和文档。

 

从菜单栏中选择File | Save Project或单击Project工具栏上的Save Projec按钮保存项目。

本入门教程到此结束。

以上就是好酷屋教程网小编为您收集和整理的Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 绘制简单分子相关内容，如果对您有帮助，请帮忙分享这篇文章^_^

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