孢子化卵囊被猪吞食侵人机体后，卵囊和孢子囊即被消化，子孢子随淋巴、血液循环散布于脑、心、肺、肝、淋巴结和肌肉等全身多种器官和组织，并在细胞中寄生和繁殖，形成包囊（内有滋养体），致使脏器和组织细胞遭到破
细菌黏附于未成熟肠上皮细胞的顶部并由此侵人细胞，黏附和侵人的过程似乎需要细菌-宿主细胞间的相互作用。肠道感染、病灶增生和排毒大约持续4周，长的可达10周，通常50%的猪有中度腹泻，100%的猪产生增生
